Vanligvis bruker kjølte kjølelager kjølesystemer som bruker en væske med svært lav fordampningstemperatur (som ammoniakk eller Freon) som kjølemiddel. Dette kjølemediet fordamper under lavt trykk og mekanisk kontroll, absorberer varme fra lagringsområdet og oppnår dermed kjøling og temperaturreduksjon.
Det mest brukte er kompresjonskjølesystemet, som hovedsakelig består av en kompressor, kondensator, ekspansjonsventil og fordamperspoler. Basert på arrangementet av fordamperspolene, kan det deles inn i to typer: direkte kjøling og indirekte kjøling. Ved direkte kjøling er fordamperbatteriene installert inne i kjølerommet. Når det flytende kjølemediet passerer gjennom fordamperbatteriene, absorberer det varme direkte fra rommet, og senker dermed temperaturen.
Ved indirekte kjøling trekker en blåser luft fra lagerrommet inn i en luftkjøleanordning. Luften avkjøles ved å absorbere varme fra fordamperbatteriene inne i kjøleanordningen, og returneres deretter til lagerrommet. Fordelene med luftkjøling er rask avkjøling, jevnere temperaturfordeling i lagerrommet, og evnen til å fjerne skadelige gasser som karbondioksid produsert under lagring.
